1月

6-9日  医院第一期管理干部培训班开课。

7日  119名临床医学生进入医院开始临床教学。

8日  医院干保支部、手麻支部、行政支部和党委机关支部被西安医科大学评为先进党支部，党委获优秀组织奖。

2月

9-11日，12-14日  医院举行第二期、第三期管理干部培训班。

12日  陕西省卫生厅正式发文，西安医科大学第二附属医院经中国爱婴医院最高审批委员会批准为爱婴医院，由联合国儿童基金会、世界卫生组织和卫生部授予爱婴医院牌匾。

麻醉科主任吴举民获陕西省卫生厅1997年度“505医德奖”三等奖。

3月

22-24日  医院主办1998年陕西省眼科年会。

本月  眼科、皮肤科、消化内科被卫生部批准为首批临床药理基地。

本月  经陕西省卫生厅研究决定，耳鼻喉科石季参加1998年援藏医疗队。

5月

2日  医院举办建院60周年庆祝活动。卫生部长张文康、副部长孙隆春、陕西省委书记李建国、省长程安东、常务副市长贾治邦、省委副书记艾丕善、副省长范肖梅、赵德全、陈兴宗、西安市委书记崔林涛、市长冯煦初为医院题词致贺。陕西省政协副主席王世臣、省政府副秘书长梁和平、省卫生厅厅长刘爱梅、副厅长耿庆义、杨世兴、省教委副主任胡致本、西安医科大学党委书记朱宏亮、校长任惠民等出席。耿庆义为医院再次成为三级甲等医院授牌。

6日  陕西省卫生厅决定成立陕西省干部医疗保健专家组，普外科秦兆寅任副组长，专家组成员中有二附院万恒麟、叶复来、刘文超。

28日  陕西省教育委员会、陕西省科学技术委员会、陕西省计划委员会（陕教科发〔1998〕15号）联合批准成立“陕西省胃肠动力疾病研究重点实验室”，设在西安医科大学附属第二医学院。

本月  医院被陕西省政府指定为“对人耳伤害医学鉴定可重新鉴定医院。”

6月

16日  临床医学遗传研究室与妇产科分开，独立核算。

本月  李宗芳、肖生祥获第二届陕西省青年科技奖。

7月

1日  院党委召开庆“七一”总结暨表彰大会，新党员进行了宣誓。

本月  院党委举办纪念建党77周年党的知识竞赛。

8月

31日  国务院学位委员会及省学位委员会批复西安医科大学内科系血液病、消化学病为博士学位授予点。

本月  西安医科大学药学系第二临床药学教研室在二附院成立。

本月  医院与美国SANDHILL公司合办的“胃肠动力研究中心”在消化内科挂牌成立。

9月

本月  眼科开展白内障超声乳化术。

10月

9-14日  日本大阪大学医学部眼科主任田野保雄及助手大路正人博士应邀来校进行学术交流活动，同眼科共同会诊疑难眼病患者，并进行了玻璃体视网膜手术。校长任惠民代表西安医科大学聘任田野保雄教授为西安医科大学名誉教授。

20日  西安医科大学校长办公室决定任命罗金燕为胃肠动力疾病研究重点实验室主任，龚均、金捷、雷小莹、宋厂义为副主任。

本月  消化内科罗金燕、龚均、朱有玲、王学勤等著的《胃肠运动与疾病》获1998年度卫生部医药卫生科技进步三等奖。

12月

    19-20日  中共西安医科大学第二临床医学院（第二附属医院）第四次代表大会举行，大会正式代表123人，代表全院560名党员，选举产生第四届党的委员会和纪律检查委员会，王清莲、韦俊荣、齐乃新、纪宗正、张宪生、赵路、程延安当选为新一届党委会委员；韦俊荣、刘武娃、段宗明、贺西京、魏龙华当选为纪委委员。王清莲当选院党委书记，韦俊荣当选院党委副书记；会议通过了院纪律检查委员会第一次全委会选举结果，韦俊荣当选院纪委书记。

本年  接国家科技部国科发财字（1998）492号文通知，医院承办的《中国儿童保健杂志》被批准为全国性正式期刊，向国内外正式发行，为双月刊。

本年  小儿外科高亚在国内率先开展巨结肠经肛门拖出根治术。

本年  神经内科与神经外科联合组建神经病学教研室，赵英贤任教研室主任，师蔚任教研室副主任。

本年  国家教育部批准皮肤病与性病医院为皮肤病学博士授予点。

本年  病理科引进病理图文分析系统，研发了具有完全自主知识产权的“双排病理取材刀”。

本年  核医学科在西北首先成立了甲状腺专科门诊，使以131I治疗甲亢与甲状腺癌为特色的综合诊治甲状腺病模式形成雏形。

本年  皮肤科肖生祥教授入选“陕西省‘三五’人才”。

本年  经向全院职工征集并经党委会批准，二附院使用新的梅花形院徽，并确定院训为“救死扶伤、患者至上、团结创新、求实奉献。

本年  医院共获各级各类科研成果奖21项，其中卫生部三等奖1项、陕西省教委一等奖1项、陕西省教委二等奖3项、陕西省政府二等奖2项、陕西省政府三等奖3项、陕西省中医药管理局一等奖1项、陕西省中医药管理局三等奖1项、陕西省环保局二等奖1项、西安市二等奖2项、西安市三等奖2项、西安市四等奖4项。